《拳皇》系列根据剧情发展可分为以下四个主要篇章：
一、大蛇篇（1994-1997年）
包含作品：《拳皇94》《拳皇95》《拳皇96》《拳皇97》
核心内容：以守护人类与恶势力斗争为主线，大蛇作为核心反派象征人类与自然的冲突。草薙京、八神庵、神乐千鹤等经典角色在此篇登场，剧情围绕最终BOSS大蛇四天王之一的暴风高尼兹展开。
二、音巢篇（1999-2001年）
包含作品：《拳皇99》《拳皇2000》《拳皇2001》
核心内容：聚焦NESTS组织及其科技实验。伊格尼兹（IGNIZ）为幕后黑手，企图通过“生命体实验”实现神化。剧情包含“KYO复制计划”和“Brutal God计划”等关键事件。
三、遥远彼之地篇（2003-2014年）
包含作品：《拳皇2003》《拳皇11》《拳皇13》《拳皇14》
核心内容：引入神秘种族“遥远彼之地”，其成员如Meisti（伊格尼斯秘书）等拥有特殊能力。剧情探讨科技与伦理的冲突，强调和平与进化理念。
四、新篇章（2015年至今）
包含作品：《拳皇15》
核心内容：延续前作宇宙观，但具体剧情未详细说明。该作标志着系列进入新阶段，角色和玩法进一步创新。
补充说明
时间线特点：前三个篇章以年份命名，2003年后改为数字序号。
玩家评价：大蛇篇因角色丰富性和玩法创新成为经典，音巢篇因剧情争议较大，遥远彼之地篇则因精品化制作和电竞化趋势受到关注。
以上划分综合了角色、剧情和玩法演变，涵盖《拳皇》系列主线故事的核心脉络。