根据现有信息，山东省自然村数量存在不同统计口径的差异，综合权威资料整理如下：
历史数据（1990年统计） 1990年数据显示，山东全省共有自然村约10.7387万个。
近年统计口径差异
- 行政村与自然村数量： 截至2020年6月，山东有7.4万个行政村和9.0万个自然村。但需注意，自然村数量可能因统计标准（如是否包含行政村、是否含自然村等）不同而有所差异。 - 最新保护利用动态
权威认定数据
山东目前有37个国家级传统村落，但这一数据仅涉及传统村落，不代表全省自然村总数。
总结：
若以1990年数据为准，山东自然村数量为10.7万；
若以2020年最新数据参考，自然村数量可能接近或略高于9万，但具体需以官方最新公告为准。- 建议通过山东省民政厅或乡村振兴部门获取最新统计结果。